DSPath 4X One-Step Multiplex Master Mix 實驗方案 1
針對猴痘病毒(Monkeypox virus, MPXV)的(de)定性實時(shí)聚合酶鏈反應(Real-time PCR)檢測:
1. 研究背景與目的(de)
- 猴痘病毒(MPXV)是(shì)正痘病毒屬(Orthopoxvirus, OPXV)的(de)一(yī / yì /yí)種,自天花根除以(yǐ)來(lái),已成爲(wéi / wèi)由OPXV引起的(de)最嚴重疾病。
- 2022年全球猴痘疫情的(de)爆發促使需要(yào / yāo)增加臨床測試的(de)診斷能力。
- 研究目的(de)是(shì)驗證一(yī / yì /yí)種定性的(de)OPXV實時(shí)PCR檢測方法,并描述其在(zài)臨床實驗室診斷MPXV的(de)分析性能。
2. 材料與方法
2.1 分析性能實驗材料
- 使用含有合成MPXV DNA的(de)通用轉運介質(UTM)或病毒轉運介質(VTM)進行實驗。
2.2 DNA提取
- 使用核酸提取儀器進行自動化核酸提取。
2.3 實時(shí)TaqMan PCR檢測
- 總反應體積:20 µL(包含5 µL的(de)模闆和(hé / huò)15 µL的(de)主混合液)。
- 主混合液成分:
- 5 µL DSPath 4X One-Step Multiplex Master Mix (GDSBio, V5005)。
- 7 µL dH2O。
- 1 µL 正向引物(10 nm)。
- 1 µL 反向引物(10 nm)。
- 1 µL 探針(5 nm),針對OPXV目标序列。
- 臨床樣本測試:當加入内控時(shí),dH2O的(de)體積減少至4 µL,以(yǐ)允許加入1 µL的(de)正向和(hé / huò)反向引物(各10 nm)和(hé / huò)探針(5 nm),針對人(rén)類RNAseP基因。
- 實時(shí)PCR操作:使用Prism 7500序列檢測系統(Applied Biosystems),并按照以(yǐ)下循環條件進行:
- 1個(gè)循環:95.0°C持續2分鍾。
- 40個(gè)循環:95.0°C持續3秒,60.0°C持續31秒。
在(zài)這(zhè)項實驗中,實時(shí)PCR是(shì)用來(lái)檢測和(hé / huò)定量猴痘病毒DNA的(de)。使用的(de)TaqMan化學方法是(shì)一(yī / yì /yí)種常用的(de)熒光定量PCR技術,它可以(yǐ)在(zài)PCR擴增過程中實時(shí)監測DNA的(de)累積量。通過這(zhè)種方式,可以(yǐ)準确測定病毒DNA的(de)濃度,從而(ér)幫助診斷猴痘病毒感染。
以(yǐ)下是(shì)實驗中使用的(de)引物和(hé / huò)探針序列:
1. OPXV目标的(de)引物和(hé / huò)探針序列:
- 正向引物(F): `TCAACTGAAAAGGCCATCTATGA`
- 反向引物(R): `GAGTATAGAGCACTATTTCTAAATCCCA`
- 探針(P): `FAM-CCATGCAATATACGTACAAGATAGTAGCCAAC`
2. 人(rén)類RNAseP基因作爲(wéi / wèi)内控的(de)引物和(hé / huò)探針序列:
- 正向引物(F): `AGATTTGGACCTGCGAGCG`
- 反向引物(R): `GAGCGGCTGTCTCCACAAGT`
- 探針(P): `Cy5–TTCTGACCTGAAGGCTCTGCGCG`
3. 首月測試中得到(dào)的(de)陽性患者樣本也(yě)在(zài)内部使用基于(yú)研究的(de)猴痘特異性PCR進行了(le/liǎo)檢測,使用的(de)引物和(hé / huò)探針序列(針對B6R基因):
- 正向引物(F): `ATTGGTCATTATTTTTGTCACAGGAACA`
- 反向引物(R): `AATGGCGTTGACAATTATGGGTG`
- 探針(P): `FAM-AGAGATTAGAAATA`
2.4 檢測限(LOD)
- 通過将MPXV DNA稀釋至不(bù)同濃度并檢測,确定LOD。
2.5 可重複性
- 使用100個(gè)拷貝/mL的(de)MPXV陽性樣本和(hé / huò)陰性UTM/VTM評估可重複性。
2.6 特異性
- 測試已知陽性患者樣本,包括單純疱疹病毒1型、2型等,以(yǐ)确定特異性。
2.7 一(yī / yì /yí)緻性
- 使用88個(gè)盲樣(包括陰性和(hé / huò)不(bù)同濃度的(de)陽性樣本)進行測試。
這(zhè)個(gè)實驗方案詳細地(dì / de)描述了(le/liǎo)從樣本收集、核酸提取、實時(shí)PCR檢測到(dào)結果分析的(de)全過程。
DSPath 4X One-Step Multiplex Master Mix
貨号:V5005,V5006
産品簡介
DSPath 4X One-Step Multiplex Master Mix是(shì)用于(yú)一(yī / yì /yí)步法多重熒光定量PCR的(de)試劑。它以(yǐ)探針和(hé / huò)特異性引物來(lái)定量檢測RNA或DNA靶标序列。優化的(de)緩沖液組分可以(yǐ)協助在(zài)一(yī / yì /yí)個(gè)體系内完成多達4個(gè)RNA或DNA序列的(de)多重定量PCR。該混合液以(yǐ)4倍濃度提供,能夠加入更多的(de)模闆進行反應,從而(ér)提高檢測的(de)靈敏度。
産品用途
探針法多重基因表達分析
産品特點
全預混,使用方便
可同時(shí)檢測多個(gè)靶标
高靈敏度,檢測低拷貝基因
耐受臨床樣本抑制劑
含防污染系統,減少交叉污染